父は、事業を興し、それなりの財を築き、子供3人もそれぞれ独立しています。
 母が死亡後、父は若い女性を嫁にもらいました(入籍済)。

父は入籍後2ケ月で死亡しました。聞くところによると、後妻さんは法定相続分は半分だそうです。せめて3年以上夫婦であったら、納得するかもしれないが、やりきれない気持ちです。相続財産を渡さない方法はありますか?

ありません。
法定相続分も遺留分も婚姻期間の長短とは関係ありません。

最近、こういう相談が増えています。
入籍後、毎日銭勘定をしていたとか、いろいろ悪口を聞かされますが、お父様が残された財産ですから、お父様が納得されているのですから良いじゃあないですか。
としか言いようがありません。